Hoy en la madrugada me la pase con una dura lucha con Aptana 3 para que pueda correr correctamente, lucha tras lucha, y nada por ultimo si dio =') al fin pero para poder automatizar esta tarea arme el siguiente script, el cual me ayuda a instalar correctamente para después poder lanzarlo, este script lo que hace es descomprimir y proceder con los archivos de configuración. Esta basado en el post de Ubuntu-Guia modificando y agregando las 5 primeras lineas en ese post tenemos varias formas de poder configurarlo, lo cual no entra en el post obviamente para que hacerlo si allí tenemos lo necesario.